Сюжет истории «Могила Светлячков» основан на знаменитом автобиографическом романе «Могила светлячков» японского писателя Носаки. Оставшиеся одни после смерти родителей Сэйта и его маленькая сестра Сэцуко пытаются вновь вернуться к нормальной жизни. Всячески пытаясь забыть о страшной трагедии, молодой парень вскоре делает всего одну ошибку, которая кончается еще одной катастрофой, «Могилой светлячков»…